Only или alone? Что вставить в предложение?

Answer 1

Чисто эстетически - дабы не повторять (ся) в рамках единого предложения.
Во-вторых (строках) само происхождение ONLY = ONE-ly (единственно / нный) То есть употребляется со словами, заменителем которых может выступать местоимение ONE
Например, "Of all her cars ONLY ONE was on the move"

Answer 2

treated with this drug only - всего лишь лечили этим лекарством (или вариации с перестановкой слов)
treated with this drug alone - лечили одним только этим лекарством без добавления других