Как по английски лучше сказать ? "это должно быть твоя флейта?

Answer 1

Это, должно быть, твоя флейта. - Это не вопрос, а утверждение. И переводится оно утвердительным предложением, а не вопросительным. Так, например: It must be your flute.
It's your flute, I guess.
Или можно просто спросить: Is it your flute? (Это твоя флейта? )

Answer 2

Твои варианты неправильные. Модальные глаголы не используются с глаголом to be. Я бы просто спросил и не заморачивался: "Is this your flute? " или "It must be your flute, mustn't it? "