При половом размножении ДНК разрезается, а гены перемешиваются. Неужели этот процесс не повреждает геном?

Answer 1

Это редко приводит к проблемам, потому что ДНК разрезается и склеивается не как попало - нужен длинный комплементарный участок на второй цепи. Это гарантирует, что хроматиды обменяются примерно одинаковыми кусками.

Answer 2

Сие есть бред сивой кобылы. Сперматозоиды содержат в себе хромосомы не парами, а подиночке, то же касается и яйцеклетки. При слиянии два набора хромосом формируют две пары хромосом будущего плода (или нескольких однояйцевых плодов)
Какие хромосомы (единичные) будут выбраны из пары, определяется при каждом рождении сперматозоида, таким образом одну яйцеклетку "атакуют" сперматозоиды, содержащие разные наборы хромосом. Аналогичный процесс происходит при формировании яйцеклетки, то есть разные яйцеклетки имеют также разный набор единичных (не парных) хромосом.