Изучите приведённые ниже последовательности ДНК и определите консенсусную последовательность

Question

Помогите пожалуйста, как определить эту консенсусную последовательность?
Изучите приведённые ниже последовательности ДНК и определите консенсусную последовательность
TAGGACT - TCGCAGA - AAGCTTG - TACCAAG - TTCCTCG

Answer 1

Для определения консенсусной последовательности из предоставленных последовательностей ДНК, нужно проанализировать каждое положение почерёдно и определить наиболе часто встречающийся нуклеотид в каждой позиции.

Пусть последовательности ДНК будут:

1. TAGGACT
2. TCGCAGA
3. AAGCTTG
4. TACCAAG
5. TTCCTCG

Проанализируем каждую позицию:

- Позиция 1: T, T, A, T, T - консенсус: T
- Позиция 2: A, C, A, A, T - консенсус: A
- Позиция 3: G, G, G, C, C - консенсус: G
- Позиция 4: G, C, C, C, C - консенсус: C
- Позиция 5: A, A, T, A, C - консенсус: A
- Позиция 6: C, G, T, C, C - консенсус: C
- Позиция 7: T, A, G, A, G - консенсус: A

Таким образом, консенсусная последовательность будет: TAGCATC. G
- Позиция 4: G, C, C, C, C - консенсус: C
- Позиция 5

Answer 2

Конечно! Давайте определим консенсусную последовательность для данных ДНК-фрагментов.
 
Выравнивание последовательностей: Сначала выравняем данные последовательности ДНК друг с другом. Это позволит нам сравнить их и найти общие элементы.
Подсчет консенсуса: После выравнивания мы будем анализировать каждую позицию в последовательности и определять, какой нуклеотид (A, T, G или C) наиболе часто встречается на данной позиции.
Давайте начнем:
 
Первая позиция:
T (TAGGACT)
T (TCGCAGA)
A (AAGCTTG)
T (TACCAAG)
T (TTCCTCG)
Наиболе часто встречающийся нуклеотид: T
Вторая позиция:
A (TAGGACT)
C (TCGCAGA)
A (AAGCTTG)
A (TACCAAG)
T (TTCCTCG)
Наиболе часто встречающийся нуклеотид: A
Третья позиция:
G (TAGGACT)
G (TCGCAGA)
G (AAGCTTG)
G (TACCAAG)
C (TTCCTCG)
Наиболе часто встречающийся нуклеотид: G
Четвертая позиция:
G (TAGGACT)
C (TCGCAGA)
C (AAGCTTG)
C (TACCAAG)
C (TTCCTCG)
Наиболе часто встречающийся нуклеотид: C
Пятая позиция:
A (TAGGACT)
A (TCGCAGA)
T (AAGCTTG)
C (TACCAAG)
C (TTCCTCG)
Наиболе часто встречающийся нуклеотид: C
Шестая позиция:
C (TAGGACT)
G (TCGCAGA)
T (AAGCTTG)
A (TACCAAG)
T (TTCCTCG)
Наиболе часто встречающийся нуклеотид: T
Седьмая позиция:
T (TAGGACT)
A (TCGCAGA)
G (AAGCTTG)
G (TACCAAG)
C (TTCCTCG)
Наиболе часто встречающийся нуклеотид: A
Таким образом, консенсусная последовательность для данных фрагментов ДНК будет: TAGCGCT.