Если атом это структура имеющая постоянное движение то как предметы состоящие из атомов не изменяют свою форму, размеры?

Answer 1

Потому что движение — в пределах структуры, если она имется при данном агрегатном состоянии. Например, если машинёшки едут в пределах МКАД, то форма и размеры МКАД не изменятся.