Как убрать шум?

Answer 1

У этой схемы огромные искажения, отсюда и "шум" при выходе транзистора из режима, что особо ярко выражено при большой амплитуде. Использовать нормальную схему вместо этой чуши для школьников, на трёх деталях высоколинейный усилитель не сделать.

Answer 2

Кондер тут для того и нужен, что бы гальванически разделить вход и выход. Это во-первых. А во-вторых у транзистора есть линейная зависимость и в усилках он должен быть выведен на самый ровный участок графика вольт-амперной характеристики. Долго объяснять. Почитай об этом. И подрегулируй резистор на базе, возможно что транзистор уведен за пределы линейности.
Слишком умно получилось.