Почему в математике расстояние обозначается S, а в физике r?

Answer 1

Неправда ваша. Мало научных трудов прочитал, однако.
А те, что прочитал, не научные труды, а учебники одного стиля.
Подразумевается, вероятно, r - модуль длины радиус-вектора (radius) . А S - пройденный путь stadium. Возможно и L вместо S и вобще по-всякому, как модно и принято в тусовке автора учебника.