Question

Почему каждый русский глагол системно имет два варианта основы, а у всей совокупности глаголов в русском языке имется множество словоизменительных классов?

Answer 1

Потому что язык - это живой организм. У редкоупотребляемых глаголов эти основы совпадают, но у глаголов, которые как говорится "у всех на устах" за время развития устной речи основы настоящего времени упростились, так сказать, для боле легкого произношения. Это не только в русском языке, это во многих языках, где глаголы склоняются, и даже в тех языках, где не склоняются (вспомните 3 формы неправильных глаголов английского языка) .