как охарактеризовать точне? в таблице Д. И. Менделева молекулы или атомы ?

Answer 1

Таблица Менделева составлена исходя из свойств атомов, сответственно, свойства указаны для одного атома вещества - вес, заряд, проче.
Только следует помнить, что атомы инертных газов (гелий, аргон, неон, erc) являются одновременно молекулами, поскольку в нормальных условиях не образуют связей

Answer 2

В таблице Менделева именно атомы, в химии их называют элементами. Если говорить ОЧЕНЬ точно, то это изотопы.
Вы говорите, что ртуть и водород — это молекулы, Вы правы, но в таблице Менделева записаны именно атомы ртути и водорода, из которых состоят эти молекулы.