Почему тут артикль?

Answer 1

Разговор о вещам можно начинать, в основном, трояко:
1) It is a (неопр. артикль = классификация = один из, дале уже "the")
2) This (that) is a ЛИБО These (those) are (для мн. числа: эти - те)
3) There is a. (are - для мн. числа - впрочем, времена можно поменять)

That (this is a. ) - здесь THAT = подлежаще, такова конструкция, НО
That (this pen is blue) - сугубо местоимения = атрибут существительного

Answer 2

Артикль и указательное местоимение в данном примере служат разной цели.
Вот если бы было this pen, тогда артикль не был бы нужен (его роль играет this) .
А так в обоих случаях идёт речь про некий объект, который ране не упоминался - ручка, карандаш.

This is a pen. The pen is red. Это - ручка. РУЧКА - красного цвета.
Говоря лингвистическими терминами, в первом предложении a pen - это рема (новое в предложении) , а во втором - тема (уже известная информация) . Наличие указательного местоимения на эту ситуацию никак не влияет. В русском же языке, как видим, подобная тема-рематическая цепочка строится за счёт изменения порядка слов.