Пространстве между атомами, намного больше самих атомов, значит темная энергия это пространство между ними?

Answer 1

В твердых и жидких телах (как говорят - в конденсированной фазе) расстояния между атомами (молекулы) примерно равны их размерам. Поэтому эти вещества плохо сжимаются. Другое дело газы. там межмолекулярные расстояния могут быть очень большими.
Но к темной энергии это все не имет отношения.