Question

Можно ли применять метод наименьших квадратов для сравнения разницы между остротой зрения до и после лечения в двух группах? учитывая что значения иногда будут отрицательными, иногда равными 0

Answer 1

А причем тут МНК? Чего от чего зависит-то? Надо просто найти дельты остроты зрения до и после лечения и проверить, значимо ли они отличаются друг от друга при данном объеме выборок! Не забыть еще до того проверить однородность дисперсии обеих выборок по критерию Фишера.
МНК, деточка, применяется в тех случаях, когда нужно аппроксимировать по известному закону (и этот закон еще надо установить! ) зависимость одной величины от другой. Например, в твоем случае (утрирую, конечно! ) это могла бы быть зависимость дельты остроты зрения до и после лечения, например, от дозировки препарата или от срока его применения) ) ) Или от обоих параметров вместе, в случае двухмерного МНК) )
Обработка результатов наблюдений с помощью математической статистики, деточка, - дело весьма непростое)