В чем разница между атавизмом и рудиментом?

Answer 1

Отличие рудиментов от атавизмов:
рудименты есть у всех особей вида, а атавизмы — лишь у немногих;
рудименты несут определенную функцию, а атавизмы (все без исключения) не несут каких-либо функций.

Answer 2

Рудимент - это в далёком эволюционном будущем атавизм.
Рудимент ещё не успел полностью исчезнуть за ненадобностью.
А атавизм исчез, но сохранился на генетическом уровне.