Существуют ли микроскопы, позволяющие увидеть атомы?

Answer 1

Ну да, изображения отдельных атомов (разумется - электронных облаков, но в принципе это ж и есть поверхность атома в структуре) , позволяют "увидеть" лучшие туннельные и атомно-силовые микроскопы, а также специальные электронные, использующие интерференционные методы повышения контраста.
 
Внутреннюю структуру увидеть НЕЛЬЗЯ.
Можно ВЫЧИСЛИТЬ размеры ядра по рассеянию частиц из ускорителей
и РАССЧИТАТЬ форму электронных орбиталей, используя уравнения квантовой механики. да и то для сложных атомов - это приближённый расчёт.

Answer 2

существует. Сканирующий атомно-силовой микроскоп. но позволить его себе могут только организации и институты. простым любителям он не доступен.

Answer 3

Увидеть можно не атом, а его туннельный контраст - трёхмерную картину, сответствующую изоповерхности постоянного тока. Туннельный контраст может не совпадать с размерами реального атома.