Что то у меня явно пробел по физике, не как не втыкаю в суть емкостей мультивибраторов

Answer 1

Ну так в цепи обратной связи резисторы на порядок разные. Установи в транзисторную схему базовые резисторы по 1 КОм и меняй емкости. Частота заметно увеличится. Да и структура логики микросхемы сильно отличается от обычного транзистора.

Answer 2

В формировании длительности импульса играет роль и резистор, через который заряжается конденсатор, а так же пороги переключения элементов - в транзисторной схеме - транзисторов, с микросхемой - уровни самой микросхемы

Answer 3

В транзисторном С3 и С4 импульсы первого МВ преобразуют в пилу, и звук по частоте будет меняться по закону пилы. Стоит ставить неправильные емкости, и на выходе получатся шелчки.